Тем временем нарастала угроза для самого Севастополя. Враг стремительно продвигался по Крыму, а войска Приморской армии еще  не  подошли  к  городу. Необходимы были экстренные меры.  30  октября  в  Севастополе  было  созвано совещание  командиров,  военкомов,  начальников  политотделов  соединений  и начальников служб флота. Совещанием  руководил  оставшийся  за  командующего начальник штаба флота контр-адмирал И.Д.Елисеев.  На нем присутствовали члены Военного совета флота - дивизионные комиссары Н.М.Кулаков  и  И.И.Азаров и контр-адмирал Г.В.Жуков, который незадолго перед тем был назначен на вновь созданную должность  заместителя  командующего  флотом  по  обороне главной базы. Гавриил Васильевич уже имел  опыт  руководства  обороной Одессы и поэтому уверенно взялся за решение такой же задачи в Севастополе.

     Совещание выработало ряд мер по укреплению обороны Севастополя. К 30 октября войска, готовые оборонять главную базу, состояли  из  двух батальонов местного стрелкового полка, 2-го и 3-го  полков  морской  пехоты, гарнизонов долговременных огневых точек (дотов) и нескольких  артиллерийских подразделений. Всего это было около 12 тысяч человек, из  них  почти  700 -лица командного состава.  В  полной  боевой  готовности  находились  батареи береговой обороны. Чтобы отразить первый натиск  противника,  следовало  по  крайней  мере удвоить численность  войск.  Ближайшими  резервами  являлись  учебный  отряд Черноморского флота, училище береговой обороны, аэродромные части ВВС, школа НКВД. Все они  сразу  получили  указание  немедленно  формировать  батальоны морской пехоты. Это составило около трех с половиной тысяч человек.

     31 октября ждали из Новороссийска 8-ю  бригаду  морской  пехоты  (около трех с половиной тысяч бойцов), а с тендровского боевого участка -  батальон Дунайской военной флотилии. Но даже с этим пополнением все равно не  хватало еще около 5 тысяч человек. Следовало немедленно формировать новые  части  из состава эвакуированных в Севастополь гарнизонов, но для них на месте не было оружия.

     Еще 30 октября за подписью И.Д.Елисеева  и  Н.М.Кулакова  пошла телеграмма в адрес командира военно-морской базы Туапсе. В ней  предлагалось срочно, "сегодня же", отобрать в частях и направить в Севастополь на эсминце "Сообразительный" 1500 винтовок. В тот же день - 30 октября - произошло  событие,  с  которого  началась 250-дневная героическая оборона Севастополя. Береговая батарея №54 под командованием старшего  лейтенанта  И.  И.  Заики, расположенная  в  районе деревни Николаевки, немного севернее города, в 16  часов  35  минут  открыла огонь по колонне вражеских танков. Противник временно прекратил продвижение, но, подтянув свежие силы, возобновил атаки. Вскоре в бой вступили  и  другие защитники Севастополя. Береговые батареи продолжали успешно отражать  натиск врага.

     1 ноября бои против гитлеровцев вела уже не  только  артиллерия,  но  и авиация  и  части  морской  пехоты.  Береговая  батарея  №30  обстреливала скопления войск противника в Бахчисарае  и  Альма-Тамаке.  Открыла  огонь  и береговая  батарея  №10.  Береговая артиллерия флота замыкалась на генерал-майора П.А.Моргунова. Его опыту многим обязан Севастополь с  самых первых  дней  борьбы.  Комендант  береговой  обороны  генерал  Моргунов  был фактическим  хозяином  на  рубеже. В дни ноябрьского  штурма  именно   он командовал не только артиллерией береговой  обороны,  но  также  батальонами дотов и  дзотов,  батареями  ПВО  и  всеми  сухопутными  флотскими  частями: бригадами, полками, отрядами.

     В тот  же  день  наша  авиация  совершила  33  боевых  вылета,  штурмуя вражеские войска в районе Николаевки, Альма-Тамака, станции Альма-Тархан.  Вернувшийся в Севастополь 2 ноября командующий Черноморским  флотом  Ф.С.Октябрьский взялся за укрепление обороны  города  и  подготовку  к  новым боям. Пополнялась Приморская армия, которая к тому  времени,  после  жестоких боев с наступавшим противником  на  севере  Крыма,  потеряла  немало  людей. Уставшая и малочисленная, она не могла успешно отражать  натиск  врага:  это пришло позднее. Генерал И.Е.Петров  5  ноября  на  Военном  совете  флота признал, что только "на базе созданного уже  флотом  с  приходом  Приморской армии Севастополь можно держать".

     В Приморскую армию влились части, только что прибывшие  в  Севастополь, несколько тысяч бойцов из Севастопольского гарнизона и 7-й  бригады  морской пехоты. Не считаясь со смертельной усталостью, доблестные  бойцы  Приморской армии занимали оборонительные рубежи вокруг города. К  9  ноября  1941  года сухопутная оборона была организована. Оборонительный  район  был  разбит  на четыре сектора. Надо сказать,  что  командование  не  ожидало  столь  быстрого  прорыва противником  Ишуньских  позиций,  и  Черноморский  флот,   естественно,   не готовился даже к частичной  эвакуации  главной  базы.  По  решению  Военного совета  флота  следовало  эвакуировать  лишь  население  и  часть   тылового имущества. Но эвакуация шла медленно. В  Севастополе  оставалось  еще  много кораблей, которые невозможно было использовать для обороны базы. Командование не спешило с эвакуацией еще и потому,  что  она  удручающе действовала на настроение людей, была тревожным признаком того,  что  город, возможно, будет оставлен. Задумываясь сейчас над этим, я прихожу  к  выводу, что в таком деле  не  должно  быть  половинчатости.  Надо  или  своевременно принять решение об эвакуации и обеспечить ее четкое проведение,  или  отдать приказ: "Держаться до последнего".

     То, что Военный совет Черноморского флота,  где  бы  он  ни  находился, прежде всего занимался обороной Севастополя, является бесспорным. Но  нельзя не отметить все же наши организационные неполадки в начальный  период  осады города, когда опасность была особенно велика. Г.И.Левченко,  ответственный по решению Ставки за оборону всего  Крыма,  4  ноября  назначил  командующим Севастопольским  оборонительным  районом  генерала  И.Е.Петрова,   хотя командующий флотом уже находился в то время в  Севастополе.  Правда,  Ф.С.Октябрьский намеревался вскоре перенести свой командный пункт в Туапсе.

     Еще 31 октября, выполняя поручение Ставки  в  Архангельске,  я  получил телеграмму начальника Главного морского штаба И.С.Исакова, Он сообщал, что командование  Черноморского  флота  предлагает  перевести  корабли  в  порты Кавказского  побережья.  Начальник  Главного  морского  штаба  считал, что артиллерийские корабли необходимо  оставить  в  Севастополе,  большую  часть подлодок и часть вспомогательных судов, ненужных для обеспечения  остающихся в Севастополе боевых кораблей, целесообразно перевести на  восток,  а  порты Кавказского побережья подготовить для базирования судового состава флота. И.С.Исаков просил утвердить эти  предложения  для  дачи  указаний  Военсовету Черноморского флота.

     Предложения И. С. Исакова после  телефонных  переговоров  с  Москвой  я одобрил, и Главный морской штаб передал их  как  директиву  Военному  совету флота. Таким образом. Военный совет флота в начале ноября  1941  года  получил указания о выводе из Севастополя ненужных для обороны города сил флота.

     Но осуществлено это было не сразу. Командующий флотом 4  ноября  послал на имя И.В.Сталина и  наркома  ВМФ  телеграмму,  в  которой  сообщал,  что произошло  резкое  ухудшение  обстановки,  и  предлагал  вывести из Севастополя боевой состав флота и рассредоточить его  по  базам  Кавказского побережья.  Для  обороны  главной  базы   командующий   предлагал   оставить контр-адмирала Г.В.Жукова на правах  заместителя  командующего  флотом,  с подчинением ему всех сухопутных  частей,  а  командный  пункт  Черноморского флота просил разрешения перенести, как было намечено ранее, в Туапсе. На телеграмму, адресованную И.В.Сталину, я не мог ответить тут же, не получив указаний Верховного Главнокомандования, а, находясь в  Архангельске, сделать это было довольно трудно.

     Вечером 5 ноября вернулся в Москву. Заслушав доклад начальника Главного морского штаба о положении в Севастополе, я уже имел возможность  обменяться соображениями об организации обороны Севастополя с начальником  Генерального штаба.Не  дожидаясь  решения   Ставки,   счел   необходимым   дать   указание командующему флотом о его местонахождении. Заместитель  начальника  Главного морского  штаба  В.А.Алафузов  послал  телеграмму  вице-адмиралу  Ф.С.Октябрьскому: "В связи  с  обстановкой  Нарком  приказал  Вам  находиться  в Севастополе. Алафузов".

     Командующий флотом, видимо, не был полностью согласен с  моим  приказом и, как пишет генерал П. А. Моргунов, объявил на совещании,  что  "пока  идет наступление, ему приказано остаться  в  Севастополе.  Окончательное  решение будет принято Ставкой".

     6 ноября Ф.С.Октябрьский послал новую телеграмму, но уже только И.В.Сталину. Положение Севастополя он оценивал в ней как критическое и  доложил, что весь основной подводный и надводный флот вывел  из  базы  на  Кавказское побережье.

     "Я назначил своим заместителем по обороне главной  базы  контр-адмирала Жукова",- сообщалось в этой телеграмме. Далее  говорилось,  что  флагманский командный пункт флота будет переведен в Туапсе.